Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palb2Q3U0P1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms