Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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