Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ctdnep1Q3TP92 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ctdnep1Q3TP92 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ctdnep1Q3TP92 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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