Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms