Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms