Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem248Q3TBN1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem248Q3TBN1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms