Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms