Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

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Length 1,339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rtl9Q32KG4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rtl9Q32KG4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rtl9Q32KG4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rtl9Q32KG4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rtl9Q32KG4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rtl9Q32KG4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rtl9Q32KG4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rtl9Q32KG4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rtl9Q32KG4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rtl9Q32KG4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl9Q32KG4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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