Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

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Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Col24a1Q30D77 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Col24a1Q30D77 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Col24a1Q30D77 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Col24a1Q30D77 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Col24a1Q30D77 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Col24a1Q30D77 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Col24a1Q30D77 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Col24a1Q30D77 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Col24a1Q30D77 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Col24a1Q30D77 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col24a1Q30D77 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms