Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDF8

Rhox4f, MCG113261, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4fQ2MDF8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rhox4fQ2MDF8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms