Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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