Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cntnap5cQ0V8T7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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