Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc21bQ0HA38 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms