Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf541Q0GGX2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms