Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms