Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms