Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms