Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rcn1Q05186 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.5 ms