Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms