Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pfdn6Q03958 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pfdn6Q03958 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pfdn6Q03958 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pfdn6Q03958 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pfdn6Q03958 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pfdn6Q03958 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pfdn6Q03958 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pfdn6Q03958 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Pfdn6Q03958 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Pfdn6Q03958 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pfdn6Q03958 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pfdn6Q03958 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pfdn6Q03958 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn6Q03958 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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