Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms