Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms