Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms