Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms