Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms