Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms