Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RykQ01887 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RykQ01887 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RykQ01887 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RykQ01887 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RykQ01887 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RykQ01887 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RykQ01887 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RykQ01887 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RykQ01887 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RykQ01887 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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RykQ01887 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RykQ01887 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RykQ01887 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RykQ01887 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RykQ01887 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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RykQ01887 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RykQ01887 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RykQ01887 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RykQ01887 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RykQ01887 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RykQ01887 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RykQ01887 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RykQ01887 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RykQ01887 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RykQ01887 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RykQ01887 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RykQ01887 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RykQ01887 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RykQ01887 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RykQ01887 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RykQ01887 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RykQ01887 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RykQ01887 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RykQ01887 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RykQ01887 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RykQ01887 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RykQ01887 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RykQ01887 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RykQ01887 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms