Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms