Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Mc1rQ01727 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms