Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SelpQ01102 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelpQ01102 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelpQ01102 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelpQ01102 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SelpQ01102 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelpQ01102 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms