Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms