Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms