Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms