Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apoa1Q00623 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms