Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1bP97358 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms