Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcgP82348 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcgP82348 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcgP82348 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcgP82348 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcgP82348 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcgP82348 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcgP82348 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcgP82348 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcgP82348 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcgP82348 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcgP82348 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcgP82348 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcgP82348 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcgP82348 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcgP82348 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SgcgP82348 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SgcgP82348 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SgcgP82348 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SgcgP82348 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SgcgP82348 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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