Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TgfbiP82198 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms