Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms