Protein–RNA interactions for Protein: P70263

Ptgdr, Prostaglandin D2 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgdrP70263 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgdrP70263 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgdrP70263 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgdrP70263 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgdrP70263 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgdrP70263 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgdrP70263 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgdrP70263 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgdrP70263 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgdrP70263 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgdrP70263 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtgdrP70263 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtgdrP70263 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtgdrP70263 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtgdrP70263 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtgdrP70263 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgdrP70263 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgdrP70263 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgdrP70263 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgdrP70263 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgdrP70263 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtgdrP70263 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PtgdrP70263 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgdrP70263 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgdrP70263 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtgdrP70263 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgdrP70263 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgdrP70263 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtgdrP70263 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms