Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gnb1P62874 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms