Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms