Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms