Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Setd4P58467 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms