Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samsn1P57725 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms