Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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NcstnP57716 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcstnP57716 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcstnP57716 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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NcstnP57716 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcstnP57716 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcstnP57716 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcstnP57716 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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NcstnP57716 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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NcstnP57716 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcstnP57716 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcstnP57716 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcstnP57716 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcstnP57716 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NcstnP57716 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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NcstnP57716 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NcstnP57716 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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NcstnP57716 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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NcstnP57716 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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NcstnP57716 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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NcstnP57716 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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NcstnP57716 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcstnP57716 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcstnP57716 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcstnP57716 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NcstnP57716 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcstnP57716 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcstnP57716 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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