Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gsc2P56916 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gsc2P56916 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gsc2P56916 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gsc2P56916 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gsc2P56916 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gsc2P56916 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gsc2P56916 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gsc2P56916 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gsc2P56916 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gsc2P56916 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gsc2P56916 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gsc2P56916 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gsc2P56916 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gsc2P56916 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gsc2P56916 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gsc2P56916 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gsc2P56916 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gsc2P56916 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gsc2P56916 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gsc2P56916 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gsc2P56916 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gsc2P56916 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gsc2P56916 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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