Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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