Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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