Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnfP51944 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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