Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TspoP50637 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms